Уже прошло 4 года с того времени, когда команда №7 лишилась одного человека – Саске Учиху. Он ушел из родного селения – Конохи, к Орочимару в поисках новой силы. Много утекло воды с того времени. В Конохе все спокойно, жизнь прекрасна, Наруто изучал искусство ниндзя у легендарного Санина – Джирайя, а Сакуру, Пятая Хокаге – Тсунаде-сама, Саске в Орочимару. Тем временем тайная организация "Акацки" начинает свои действия по поимке джинчурриков, они делают успехи... Вот две группы были посланы Лидером в Коноху для разветки. Новый Казакаге тоже обитает в Конохе некоторое время, налаживая отношения между странами. (Далее в игре будет добавляться информация сюда же...)